มูลนิธิเด็กอ่อนในสลัมฯ ก่อตั้งขึ้นเมื่อปี พ.ศ.2524 จากผู้มีจิตศรัทธา 5 ท่าน ได้แก่ คุณครูประทีป อึ้งทรงธรรม ฮาตะ นางนงเยาว์ นฤมิตรเรขการ นายนรรัตน ตั้งปรกรณ์ Mr.Shuzuki Iwazgi และนางทองสุข อึ้งทรงธรรม เพื่อดำเนินการเปิดบ้านเลี้ยงเด็กอ่อนในสลัม ดูแลเด็กวัยแรกเกิด - 3 ปี ในบริเวณล็อค 12 ชุมชนคลองเตย เพื่อให้การดูแลเด็กตอนกลางวัน โดยให้การอบรมเลี้ยงดูเด็กด้วยความรัก และเอาใจใส่ ส่งเสริมการเรียนรู้ในด้านต่างๆ ให้เหมาะสมตามวัย ต่อมามูลนิธิฯ ได้ขยายการช่วยเหลือเด็กเป็นวัย 0 – 5 ปี ในปีพ.ศ.2526 สมเด็จพระเจ้าพี่นางเธอ เจ้าฟ้ากัลยาณิวัฒนา กรมหลวงนราธิวาสราชนครินทร์ ทรงมีพระกรุณาธิคุณรับมูลนิธิฯ ไว้ในพระอุปถัมภ์ ด้วยทรงห่วงใย และทรงพระเมตตาต่อเด็กที่ด้อยโอกาสในชุมชนแออัด ได้รับการจดทะเบียนเป็น "มูลนิธิเด็กอ่อนในสลัม ในพระอุปถัมภ์สมเด็จพระเจ้าพี่นางเธอ เจ้าฟ้ากัลยาณิวัฒนา กรมหลวงนราธิวาสราชนครินทร์" ไ ด้จดทะเบียนกับคณะกรรมการวัฒนธรรมแห่งชาติ กระทรวงมหาดไทย ให้มีฐานะเป็นนิติบุคคลตั้งแต่วันที่ 18 มกราคม 2527 เป็นองค์การสาธารณกุศลลำดับที่ 208 เงินบริจาคใช้หักลดหย่อนภาษีได้